[Anderson Paraibano]

Recentemente, um problema comum tem surgido em fóruns e comunidades de usuários do R em sistemas Ubuntu relacionado à vinculação do R a um BLAS compartilhado. Embora muitos usuários tenham construído o R com a opção –with-blas=lblas, eles ainda estão encontrando dificuldades para fazer a vinculação correta. Neste artigo, exploraremos as possíveis razões pelas quais isso pode estar acontecendo e forneceremos uma solução para resolver esse problema.

O R é uma linguagem de programação estatística amplamente utilizada, conhecida por sua flexibilidade e variedade de pacotes e bibliotecas disponíveis. Um aspecto importante do R é sua capacidade de realizar operações numéricas eficientes, como cálculos matriciais e álgebra linear. Para isso, o R faz uso de uma biblioteca chamada BLAS (Basic Linear Algebra Subprograms), que é responsável pela execução de operações numéricas de alto desempenho.

Ao compilar o R em sistemas Ubuntu, é comum usar a opção –with-blas=lblas durante o processo de configuração. Essa opção instrui o compilador a usar a biblioteca OpenBLAS, que é uma implementação otimizada do BLAS, para realizar cálculos numéricos no R. No entanto, mesmo com essa opção configurada corretamente, alguns usuários relatam que o R não está vinculado corretamente ao BLAS compartilhado e continua usando uma versão mais antiga ou incorreta.

Existem algumas possíveis razões pelas quais isso pode ocorrer. Uma delas é que o sistema Ubuntu possui uma biblioteca BLAS padrão instalada que entra em conflito com a biblioteca OpenBLAS desejada. Isso pode acontecer porque o Ubuntu tem uma implementação BLAS de referência chamada libblas, que pode ser vinculada automaticamente pelo R em vez da versão desejada.

Para resolver esse problema, é necessário ajustar a configuração do R e garantir que ele seja vinculado corretamente à biblioteca OpenBLAS. Aqui está um procedimento que pode ser seguido:

Primeiro, verifique se a biblioteca OpenBLAS está instalada corretamente no seu sistema Ubuntu. Você pode fazer isso usando o gerenciador de pacotes apt com o seguinte comando:

Copy code
sudo apt install libopenblas-dev
Em seguida, abra o terminal e navegue até o diretório onde o R foi construído. Provavelmente, isso será algo como ~/R-x.x.x (onde x.x.x é a versão do R que você compilou).

Dentro desse diretório, execute o seguinte comando para abrir o arquivo config.site:

arduino
Copy code
nano config.site
No arquivo config.site, adicione a seguinte linha:

makefile
Copy code
LDFLAGS=”-L/usr/lib/openblas-base”
Salve o arquivo e saia do editor de texto.

Agora, execute o seguinte comando para reconfigurar o R com as novas configurações:

bash
Copy code
./configure –with-blas=lblas
Finalmente, compile e instale o R com os seguintes comandos:

go
Copy code
make
sudo make install
Ao seguir essas etapas, você deve ser capaz de vincular o R corretamente à biblioteca OpenBLAS compartilhada em seu sistema Ubuntu. Isso garantirá que o R aproveite as otimizações de desempenho oferecidas pela OpenBLAS durante os cálculos numéricos.

Em conclusão, embora a opção –with-blas=lblas seja comumente usada para vincular o R à biblioteca OpenBLAS em sistemas Ubuntu, alguns usuários podem encontrar problemas de vinculação incorreta. No entanto, ajustando as configurações do R e seguindo o procedimento mencionado acima, é possível resolver esse problema e desfrutar dos benefícios da implementação otimizada do BLAS fornecida pela OpenBLAS no R.

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